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Enregistrement W2418023999 · doi:10.5588/ijtld.14.0521

Relationship of <I>HLA-DRB1</I> gene polymorphism with susceptibility to pulmonary tuberculosis: updated meta-analysis

2015· review· en· W2418023999 sur OpenAlexaboutno aff
Li Cp, Yiming Zhou, X Xiang, Maolin He

Notice bibliographique

RevueThe International Journal of Tuberculosis and Lung Disease · 2015
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineOdds ratioAlleleMeta-analysisHLA-DRB1Human leukocyte antigenTuberculosisConfidence intervalCase-control studyInternal medicineIncidence (geometry)ImmunologyGeneticsGeneAntigenPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Studies indicate that human leukocyte antigen (HLA) gene polymorphisms are implicated in the risk of pulmonary tuberculosis (PTB). However, research findings are contradictory. OBJECTIVE: To examine the association between HLA-DRB1 alleles and PTB risk using a meta-analysis on case-control studies. METHODS: We searched for relevant studies in the PubMed and EMBASE databases. We used fixed-effects or random-effects models and reported combined odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CI). The Newcastle-Ottawa Scale (NOS) was used to estimate the quality of each case-control study. RESULTS: A total of 21 individual case-control studies were identified, including studies of 14 family alleles and 28 specific alleles. Compared with controls, DRB1*15 and DRB1*08:03 were found to have significantly higher frequencies in PTB patients; however, DRB1*03, DRB1*11, DRB1*11:03 and DRB1*12:02 had significantly lower frequencies in the total population. The association between other HLA-DRB1 family alleles and specific alleles and predisposition to PTB was not statistically significant. Among Asian populations, DRB1*03 and DRB1*07:01 were associated with a reduced incidence of PTB, while DRB1*15 and DRB1*08:03 were associated with an increased incidence of PTB. CONCLUSION: We conclude that HLA-DRB1 may be a valuable marker to predict the risk for PTB, especially in Asian populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens large)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,987
Score d'incertitude au seuil0,049

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0130,041
Bibliométrie0,0050,008
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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