Capturing Plant Metabolome with Direct-Immersion in Vivo Solid Phase Microextraction of Plant Tissues
Notice bibliographique
Résumé
For the first time, an in vivo sampling mode of direct immersion-solid phase microextraction (DI-SPME) was employed to capture the metabolome of living plant specimens, using apple (Malus × domestica Borkh.) as a model system. Metabolites were extracted from apple tissues and introduced by thermal desorption into a comprehensive two-dimensional gas chromatography-time-of-flight mass spectrometry instrument. The feasibility of this sampling approach, based on exploitation of microextraction principles, including negligible depletion of free analyte concentrations, solventless sampling and sample preparation, and on-site compatibility, was determined in global metabolite analysis. Rather than adopting an approach of traditional sample preparation, requiring metabolism quenching and laborious sample preparation, the objective of the study was to capture the metabolome in vivo, evaluate the feasibility of the approach to provide unbiased extraction coverage, and compare analytical precision when different SPME sampling modes are employed. The potential of in vivo DI-SPME in quantitative plant metabolomics was assessed by evaluating changes in metabolic fingerprints in response to fruit maturation. The in vivo SPME sampling approach has been demonstrated as capable of sampling living systems with high reproducibility, considering that nearly 50% of hundreds of evaluated compounds included in the determination of analytical performance met the 15% RSD FDA criterion. Esters were extracted with high repeatability (% RSD for hexyl butanoate and butyl butanoate of 16.5 and 5.9, respectively, from 9 determinations in 3 apples) and found to be upregulated in response to apple fruit maturation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».