PWE-186 Use of dna ploidy in routine pathology practice as a biomarker for barrett’s oesophagus with high risk clinical features
Notice bibliographique
Résumé
Introduction Barrett’s oesophagus (BE) is considered to be associated with an increased risk of esophageal adenocarcinoma (OAC), but the risk of progression is low and unpredictable. Previous studies have demonstrated a higher risk of progression in BE patients with: low grade dysplasia; segment length >8 cm; a family history of OAC and residual BE post treatment for OAC (surgery, chemoradiotherapy or endoscopic therapy). We and others have previously demonstrated that DNA ploidy abnormalities can act as prognostic biomarkers for the risk of progression to OAC. The aim of this study was to assess DNA ploidy in high risk groups using routine biopsy samples taken at surveillance endoscopy in a clinical setting. Method Prospective study of patients undergoing routine BE surveillance at three centres. All biopsy samples were dual reported by two expert pathologists. DNA ploidy analysis was undertaken using Image cytometry (ICM) on Formalin Fixed Paraffin Embedded tissue, as previously described.1All samples were analysed to the same protocol. Results A total of 51 patients underwent DNA ploidy analysis over a 2 year period. Mean age was 63 years (range 22–86 years), 82% male. Results are shown in Table 1. There was high prevalence of DNA ploidy abnormalities (aneuploidy) in the LGD group at 33%. DNA ploidy abnormalities were not identified in other groups on this study. Conclusion This study demonstrates the presence of aneuploidy is significantly higher in low grade dysplasia than other high risk clinical groups, with a third of patients displaying genomic instability. DNA ploidy ICM may be useful in routine pathology practice to risk stratify patients with LGD. The role of DNA ploidy in non dysplastic BE with high clinical risk cannot be concluded from this small cohort. Disclosure of interest None Declared. References Dunn JM, Mackenzie GD, Oukrif D, et al.Image cytometry accurately detects DNA ploidy abnormalities and predicts late relapse to high grade dysplasia and adenocarcinoma in Barrett–s oesophagus following photodynamic therapy. Br J Cancer2010;102:1608–1617
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».