Founder Mutation for a-sarcoglycan-LGMD2D in a Magdalen Islands Acadian Cluster
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: We have recruited a group of four living and reviewed the records of six deceased distantly related French-Canadians of Acadian descent affected by a childhood-onset form of recessive limb-girdle muscular dystrophy (LGMD). All cases originate from the small archipelago of the Magdalen Islands (population: 13,000) isolated in the Gulf of St-Lawrence. METHODS: Based on the likely sharing of the same founder mutation we completed a 319K SNPs genome-wide scan to identify the disease locus and then screen candidate genes in this region. RESULTS: All patients had normal initial motor milestones. They presented with limb girdle weakness at the average age of seven years (5-11). Progressive weakness led to loss of ambulation at a wide range of ages (10-39). Patients also developed macroglossia, large calves and mild to moderate contractures, hyperlordosis and decreased pulmonary function. Creatine kinase levels were elevated (1,800-10,000 U/L) in the first decades, but decreased with progression of disease. Homozygosity mapping uncovered a shared chromosomal region of 6.33Mb. The alpha sarcoglycan (SGCA) gene, mutated in LGMD2D, lay in this candidate interval. Sequencing of all SGCA exons uncovered a shared homozygous missense mutation (c. 229C>T, p.R77C), the most common SGCA mutation internationally reported. Using demographic data, we estimated a high carrier rate of 1/22. CONCLUSION: The p.R77C mutation has also been observed in many populations, including in France and Spain (Basques). This corresponds to the first reported recessive founder disease for the Magdalen Islands, an archipelago settled in the XIXth century, largely by Acadian immigrants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».