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Enregistrement W2418810131 · doi:10.1021/acsnano.5b04387

Dynamic DNA Nanotubes: Reversible Switching between Single and Double-Stranded Forms, and Effect of Base Deletions

2015· article· en· W2418810131 sur OpenAlexafffund
Janane F. Rahbani, Amani A. Hariri, Gonzalo Cosa, Hanadi F. Sleiman

Notice bibliographique

RevueACS Nano · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Foundation for InnovationGovernment of CanadaFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesResearch Corporation for Science Advancement
Mots-clésPhotobleachingBiomoleculeNanotechnologyMaterials scienceNanotubeSingle-molecule experimentFluorescence recovery after photobleachingDNADNA origamiCarbon nanotubeBase pairHelix (gastropod)Nanoscopic scaleMoleculeFluorescenceNanostructureChemistryOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA nanotubes hold great potential as drug delivery vehicles and as programmable templates for the organization of materials and biomolecules. Existing methods for their construction produce assemblies that are entirely double-stranded and rigid, and thus have limited intrinsic dynamic character, or they rely on chemically modified and ligated DNA structures. Here, we report a simple and efficient synthesis of DNA nanotubes from 11 short unmodified strands, and the study of their dynamic behavior by atomic force microscopy and in situ single molecule fluorescence microscopy. This method allows the programmable introduction of DNA structural changes within the repeat units of the tubes. We generate and study fully double-stranded nanotubes, and convert them to nanotubes with one, two and three single-stranded sides, using strand displacement strategies. The nanotubes can be reversibly switched between these forms without compromising their stability and micron-scale lengths. We then site-specifically introduce DNA strands that shorten two sides of the nanotubes, while keeping the length of the third side. The nanotubes undergo bending with increased length mismatch between their sides, until the distortion is significant enough to shorten them, as measured by AFM and single-molecule fluorescence photobleaching experiments. The method presented here produces dynamic and robust nanotubes that can potentially behave as actuators, and allows their site-specific addressability while using a minimal number of component strands.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,419

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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