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Enregistrement W2421283750 · doi:10.1007/978-1-61779-160-4_15

Simultaneous Real-Time Imaging of Signal Oscillations Using Multiple Fluorescence-Based Reporters

2011· article· en· W2421283750 sur OpenAlexaff
Lianne B. Dale, Stephen S. G. Ferguson

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSIGNAL (programming language)FluorescenceBiological systemChemistryPhysicsComputer scienceOpticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is now well understood that G protein-coupled receptor (GPCR)-mediated cell signalling is subject to extensive spatial-temporal control, and that a meaningful understanding of this complexity requires techniques to study signalling at the molecular and sub-cellular level. This complexity in cell signal pattern begins with ligand binding to the receptor and its coupling to a variety of different effector systems. These signal transduction cascades within a cell involve a very complex series of molecular events requiring the generation of multiple second messenger responses and the activation a multiple effector proteins. In the present chapter, we will describe methodology for the simultaneous assessment of the spatial-temporal measurement of increases in intracellular Ca2+ concentrations and the activation of protein kinase C (PKC) in response to the agonist activation of a Gαq/11-coupled GPCR. Specifically, we will describe a confocal imaging approach to simultaneously measure oscillilations in intracellular Ca2+ levels and PKC translocation to the plasma membrane in response to mGluR1 stimulation in transiently transfected human embryonic kidney (HEK293) cells. The changes in intracellular Ca2+ were imaged using the fluorescent indicator Oregon Green 488 BAPTA and a recombinant PKCβII-DsRed fusion protein was used to image the sub-cellular distribution of the PKCβII isoform.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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