Structural Profiling of Short-Chain Lipopolysaccharides from Haemophilus influenzae
Notice bibliographique
Résumé
Lipopolysaccharides (LPS) are a complex class of glycolipids that can trigger a cascade of immunological responses in mammals, including endotoxic effects and serum antibody production ( 1 ). LPS have been found to exhibit a common molecular architecture consisting of at least two distinct regions: a carbohydrate containing region and a lipid moiety referred to as lipid A ( 2 ). In enteric bacteria (e.g., Escherichia coli, Salmonella spp.), the carbohydrate containing region consists of a high-molecular-mass O-specific polysaccharide that is covalently linked to a low-molecular-mass core oligosaccharide ( 3 ). Haemophilus influenzae produces only short-chain LPS in which the carbohydrate region typically contains mixtures of low-molecular-mass but structurally diverse oligosaccharide components. This pathogen remains a major cause of disease worldwide. Six capsular serotypes and an indeterminate number of nontypeable (i.e., acapsular) strains of H. influenzae are recognized. In the developed world, non-typeable (NTHi) strains are the second major cause of otitis media infections in children, while serotype b capsular strains are associated with invasive diseases, including meningitis and pneumonia ( 4 ). The carbohydrate regions of H. influenzae LPS molecules provide targets for recognition by host immune responses, and expression of certain oligosaccharide epitopes is known to contribute to disease pathogenesis. Molecular structural studies of LPS from a number of different H. influenzae strains have resulted in a structural model in which a conserved l - glycero - d - manno -heptose (Hep)-containing inner-core trisaccharide moiety is attached via a phosphorylated 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (Kdo) residue to the lipid A component ( 5 – 16 ) ( see Structure 1 ). These keywords were added by machine and not by the authors. This process is experimental and the keywords may be updated as the learning algorithm improves.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».