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Enregistrement W2422642795 · doi:10.1089/aivt.2016.0011

The Microphysiology Systems Database for Analyzing and Modeling Compound Interactions with Human and Animal Organ Models

2016· article· en· W2422642795 sur OpenAlexfundno aff
Albert Gough, Lawrence A. Vernetti, Luke Bergenthal, Tong Ying Shun, D. Lansing Taylor

Notice bibliographique

RevueApplied In Vitro Toxicology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
Thématique3D Printing in Biomedical Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesHealth CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésSafety pharmacologyDatabaseComputer scienceIn vivoExperimental dataClinical trialDrugPharmacologyMedicineBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microfluidic human organ models, microphysiology systems (MPS), are currently being developed as predictive models of drug safety and efficacy in humans. To design and validate MPS as predictive of human safety liabilities requires safety data for a reference set of compounds, combined with in vitro data from the human organ models. To address this need, we have developed an internet database, the MPS database (MPS-Db), as a powerful platform for experimental design, data management, and analysis, and to combine experimental data with reference data, to enable computational modeling. The present study demonstrates the capability of the MPS-Db in early safety testing using a human liver MPS to relate the effects of tolcapone and entacapone in the in vitro model to human in vivo effects. These two compounds were chosen to be evaluated as a representative pair of marketed drugs because they are structurally similar, have the same target, and were found safe or had an acceptable risk in preclinical and clinical trials, yet tolcapone induced unacceptable levels of hepatotoxicity while entacapone was found to be safe. Results demonstrate the utility of the MPS-Db as an essential resource for relating in vitro organ model data to the multiple biochemical, preclinical, and clinical data sources on in vivo drug effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,953
Score d'incertitude au seuil0,300

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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