MB-53hTERT EXPRESSION AND REGULATION IN PEDIATRIC MEDULLOBLASTOMA (MB)
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Telomerase reactivation, critical in many cancers, correlates with expression of its catalytic subunit hTERT. The prognostic significance of telomere maintenance mechanisms in pediatric MB has not been well described. METHODS: In this multi-institutional retrospective study of telomerase expression and hTERT regulation in newly-diagnosed children with MB, hTERT and c-MYC expression were assessed by qRT-PCR, normalized to non-neoplastic brain control samples. hTERT promoter methylation was analyzed using quantitative pyrosequencing and Illumina 450k methylation array. Cox proportional-hazard regression analyses evaluated the association of hTERT expression with progression-free survival (PFS) or overall survival (OS). Spearman and Kruskal-Wallis tests were used to correlate hTERT promoter methylation and expression and to assess variations among MB subgroups, respectively. RESULTS: Among 74 patients with hTERT expression and outcome data, higher expression was associated with worse OS (HR = 1.22, 95% CI: 1.01-1.47, p = 0.036) and PFS (HR = 1.17, 95% CI: 1.00-1.37, p = 0.051) after adjusting for subgroup. Similar results were obtained when adjusting for metastatic status. Group 3 patients had the highest hTERT expression (p = 0.001). Sixty-one patients had pyrosequencing data, 292 had 450k methylation data. hTERT promoter was differentially methylated among subgroups with WNT followed by group 3 having the highest methylation on 450k (p < 0.0001). Pyrosequencing confirmed these trends. hTERT promoter methylation moderately positively correlated with hTERT expression (Spearman correlation = 0.42, p = 0.02 by 450k and 0.34, p = 0.007 by pyrosequencing). There was no correlation between expression of hTERT and c-MYC. CONCLUSION: Increased hTERT expression is associated with worse PFS and OS in MB regardless of subgroup, making telomerase a potential therapeutic target.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».