The-N-End Rule: The Beginning Determines the End
Notice bibliographique
Résumé
In eukaryotic cells, regulated protein degradation of intracellular proteins is mediated largely by the ubiquitin proteasome system (UPS). UPS-mediated protein degradation regulates virtually all crucial aspects of cellular physiology, such as cell proliferation, cell division, cell differentiation, and cell death. Concomitantly, the deregulation by the UPS contributes to human disorders including cancer. Cellular regulation by UPS- mediated protein degradation is a highly specific and selective process that depends on time (e.g. cell cycle) and location (nucleus, mitochondria or endoplasmic reticulum). An ongoing challenge in the protein degradation field is identification of degradation signals for specific proteins that trigger their degradation by the proteasome. More than 25 years ago, the first degradation signal was discovered and defined as destabilizing N-terminal amino-acid residue (or N-degron) of protein substrates. The discovery and subsequent detailed analysis of N-degrons gave rise to the so called N-end rule, which states that the half-life time of a protein is determined by the identity of its N-terminal amino-acid residue. The N-end rule pathway recognizes proteins containing N-terminal destabilizing residues and mediates their polyubiquitination and subsequent degradation in the proteasome. Recent investigations have revealed a role for N-terminal acetylation on the recognition of N-degrons by the N-end rule pathway. Here we summarize these recent findings and highlight the impact on our understanding of the N-end rule pathway with respect to cellular physiology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».