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Enregistrement W2425634453 · doi:10.2174/0929866523666160108115809

The-N-End Rule: The Beginning Determines the End

2016· article· en· W2425634453 sur OpenAlexaff
Mohamed A. Eldeeb, Richard P. Fahlman

Notice bibliographique

RevueProtein and Peptide Letters · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDegronProteasomeProtein degradationCell biologyEndoplasmic reticulumAcetylationUbiquitinBiologyCell cycleBiochemistryUbiquitin ligaseCellChemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In eukaryotic cells, regulated protein degradation of intracellular proteins is mediated largely by the ubiquitin proteasome system (UPS). UPS-mediated protein degradation regulates virtually all crucial aspects of cellular physiology, such as cell proliferation, cell division, cell differentiation, and cell death. Concomitantly, the deregulation by the UPS contributes to human disorders including cancer. Cellular regulation by UPS- mediated protein degradation is a highly specific and selective process that depends on time (e.g. cell cycle) and location (nucleus, mitochondria or endoplasmic reticulum). An ongoing challenge in the protein degradation field is identification of degradation signals for specific proteins that trigger their degradation by the proteasome. More than 25 years ago, the first degradation signal was discovered and defined as destabilizing N-terminal amino-acid residue (or N-degron) of protein substrates. The discovery and subsequent detailed analysis of N-degrons gave rise to the so called N-end rule, which states that the half-life time of a protein is determined by the identity of its N-terminal amino-acid residue. The N-end rule pathway recognizes proteins containing N-terminal destabilizing residues and mediates their polyubiquitination and subsequent degradation in the proteasome. Recent investigations have revealed a role for N-terminal acetylation on the recognition of N-degrons by the N-end rule pathway. Here we summarize these recent findings and highlight the impact on our understanding of the N-end rule pathway with respect to cellular physiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,428
Score d'incertitude au seuil0,415

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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