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Enregistrement W2426292020 · doi:10.3389/fcimb.2016.00065

Synthetic Cystic Fibrosis Sputum Medium Regulates Flagellar Biosynthesis through the flhF Gene in Burkholderia cenocepacia

2016· article· en· W2426292020 sur OpenAlexafffund
Brijesh Kumar, Silvia T. Cardona

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular and Infection Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBurkholderia cenocepaciaCystic fibrosisSputumMicrobiologyBurkholderiaBurkholderia cepacia complexGeneBiosynthesisBiologyBacteriaMedicineGeneticsPathologyTuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Burkholderia cenocepacia belongs to the Burkholderia cepacia complex (Bcc), a group of at least 18 distinct species that establish chronic infections in the lung of people with the genetic disease cystic fibrosis (CF). The sputum of CF patients is rich in amino acids and was previously shown to increase flagellar gene expression in B. cenocepacia. We examined flagellin expression and flagellar morphology of B. cenocepacia grown in synthetic cystic fibrosis sputum medium (SCFM) compared to minimal medium. We found that CF nutritional conditions induce increased motility and flagellin expression. Individual amino acids added at the same concentrations as found in SCFM also increased motility but not flagellin expression, suggesting a chemotactic effect of amino acids. Electron microscopy and flagella staining demonstrated that the increase in flagellin corresponds to a change in the number of flagella per cell. In minimal medium, the ratio of multiple: single: aflagellated cells was 2:3.5:4.5; while under SCFM conditions, the ratio was 7:2:1. We created a deletion mutant, ΔflhF, to study whether this putative GTPase regulates the flagellation pattern of B. cenocepacia K56-2 during growth in CF conditions. The ΔflhF mutant exhibited 80% aflagellated, 14% single and 6% multiple flagellated bacterial subpopulations. Moreover, the ratio of multiple to single flagella in WT and ΔflhF was 3.5 and 0.43, respectively in CF conditions. The observed differences suggest that FlhF positively regulates flagellin expression and the flagellation pattern in B. cenocepacia K56-2 during CF nutritional conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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