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Enregistrement W24266920 · doi:10.1177/135965350801300306

Distinct Signature Type I Interferon Responses are Determined by the Infecting virus and the Target Cell

2008· article· en· W24266920 sur OpenAlexaff
Ehtesham Baig, Eleanor N. Fish

Notice bibliographique

RevueAntiviral Therapy · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyInterferonSendai virusVirusVirologyGeneGene expressionInterferon-stimulated geneImmunologyImmune systemInnate immune systemGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Type I interferons (IFN) include multiple IFN-alpha subtypes which exhibit considerable amino acid identity and activate the same cell-surface receptor. The promoter regions of the IFN-alpha genes, however, have different transcription factor binding sites, implying differential transcriptional activation. Evolutionary conservation of multiple subtypes may have resulted from external pressures associated with the crucial nature of an IFN response, namely that different viruses that are tropic for different target tissues determine the nature and extent of an IFN response, specifically the IFN-alpha subtype profile. METHODS: Studies were undertaken to examine inducible IFN gene expression profiles in response to infection with single-stranded RNA viruses: Sendai virus (SeV), murine hepatitis virus (MHV-1) and coxsackie virus B3 (CVB3). RESULTS: In vitro, distinct signature profiles of SeV and MHV-1-inducible gene expression for IFN-alpha2, IFN-alpha4 and IFN-alpha5 subtypes in L2 and L929 mouse fibroblast cells, in relation to the extent and kinetics of their induction, were identified. In vivo, whereas A/J mice are highly permissive for both MHV-1 and CVB3 infections and mount a poor IFN response, C57B1/6 mice are relatively resistant to both virus infections and mount a vigorous IFN response. CONCLUSIONS: These data suggest that the infecting virus and the target cell type dictate the extent and signature of inducible type I IFN gene expression. The extent of IFN response to viral infection influences the subsequent biological outcome: a robust IFN response prescribes a level of resistance, whereas a poor IFN response contributes towards a permissive phenotype for infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil0,492

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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