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Enregistrement W2427717657 · doi:10.1016/j.ajhg.2016.05.006

Trans-ethnic Meta-analysis and Functional Annotation Illuminates the Genetic Architecture of Fasting Glucose and Insulin

2016· review· en· W2427717657 sur OpenAlexaff
Ching‐Ti Liu, Sridharan Raghavan, Nisa M. Maruthur, Edmond K. Kabagambe, Jaeyoung Hong, Maggie C. Y. Ng, Marie‐France Hivert, Yingchang Lu, Ping An, Amy R. Bentley, Anne M. Drolet, Kyle J. Gaulton, Xiuqing Guo, Loren L. Armstrong, Marguerite R. Irvin, Man Li, Leonard Lipovich, Denis Rybin, Kent D. Taylor, Charles Agyemang, Brian E. Cade, Wei‐Min Chen, Marco Dauriz, Joseph A. Delaney, Todd L. Edwards, Daniel S. Evans, Michele K. Evans, Leslie A. Lange, Aaron Leong, Jingmin Liu, Uma Nayak, Sanjay R. Patel, Bianca Porneala, Laura J. Rasmussen‐Torvik, Marieke B. Snijder, Sarah Stallings, Toshiko Tanaka, Lisa R. Yanek, Wei Zhao, Diane M. Becker, Lawrence F. Bielak, Mary L. Biggs, Erwin P. Böttinger, Donald W. Bowden, Guanjie Chen, Adolfo Correa, David Couper, Dana C. Crawford, Mary Cushman, John D. Eicher, Myriam Fornage, Nora Franceschini, Yi‐Ping Fu, Mark O. Goodarzi, Omri Gottesman, Kazuo Hara, Tamara B. Harris, Richard A. Jensen, Andrew D. Johnson, Min A. Jhun, Andrew J. Karter, Margaux F. Keller, Abel Kho, Jorge R. Kizer, Ronald M. Krauss, Carl D. Langefeld, Xiaohui Li, Jingling Liang, Simin Liu, William L. Lowe, Thomas H. Mosley, Kari E. North, Jennifer A. Pacheco, Patricia A. Peyser, Alan L. Patrick, Kenneth Rice, Elizabeth Selvin, Mario Sims, Jennifer A. Smith, Salman M. Tajuddin, Dhananjay Vaidya, Mary P. Wren, Jie Yao, Xiaofeng Zhu, Julie T. Ziegler, Joseph M. Zmuda, Alan B. Zonderman, Aeilko H. Zwinderman, Adebowale Adeyemo, Eric Boerwinkle, Luigi Ferrucci, M. Geoffrey Hayes, Sharon L.R. Kardia, Iva Miljkovic, James S. Pankow, Charles N. Rotimi, Michèle M. Sale, Lynne E. Wagenknecht, Donna K. Arnett, Yii‐Der Ida Chen, Michael A. Nalls, Michael A. Province, W.H. Linda Kao, David S. Siscovick, Bruce M. Psaty, James G. Wilson, Ruth J. F. Loos, Josée Dupuis, Stephen S. Rich, José C. Florez, Jerome I. Rotter, Andrew P. Morris, James B. Meigs

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2016
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Human Genome Research InstituteNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesFogarty International CenterNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on Aging
Mots-clésGenetic architectureGeneticsBiologyGenome-wide association studyExpression quantitative trait lociEthnic groupQuantitative trait locusGenetic associationLocus (genetics)GeneComputational biologySingle-nucleotide polymorphismGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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