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Enregistrement W2428812392 · doi:10.17554/j.issn.2412-2424.2016.02.16

GCMS Based Detection of Lipid Biomarkers of Mycobacteriumtuberculosis in the Serum Specimen

2016· article· en· W2428812392 sur OpenAlexfundno aff
Anish Zacharia Joseph, Anubhav Jain, Mukul Pachauri, Ajay Kumar, Gbks Prasad, Prakash S. Bisen

Notice bibliographique

RevueJournal of Respiratory Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGrand Challenges Canada
Mots-clésTuberculosisMycobacterium tuberculosisSputumChromatographyChemistryLipid profileMedicinePathologyCholesterolBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: The present study is focused on the identification of high abundant and low abundant biomarkers of Mycobacterium tuberculosis from serum specimen using Gas chromatography and Mass spectroscopy. METHODS: The TB positive and negative sera were screened on the basis of sputum smear microscopy and the in house developed liposome based antibody detection kit. The lipid fraction was isolated from the collected sera and derivatized. In GCMS analysis, the derivatized lipid samples were analyzed through Gas Chromatograph Mass spectrometer (Shimadzu QP-2010 plus with Thermal Desorption system TD 20). Split or splitless mode of sample injection was performed to identify the high abundant and low abundant biomarkers of tuberculosis. RESULTS : The study identified lipid biomarkers specific for M. tuberculosis in the serum of tuberculosis positive subjects. The study revealed that lipids like C17 H34, C21H52O6, C29H60, C34H70, C44H90 was identified in the split mode of sample injection, whereas C29H60, C34H70, C44H90, C14H23BrO, C11H24O2, C18H44O5, C14H30O3S and C24H39N were identified in the splitless mode of sample injection. Under split injection mode of analysis, C17H34, C21H52O6 and C34H70 lipids were identified as low abundant lipids. The molecules like C14H23BrO, C11H24O2, C18H44O5 and C22H39N were identified as low abundant lipids even after the splitless mode of analysis. DISCUSSIONS: The GCMS analysis revealed the presence of lipid biomarkers of Mycobacterial tuberculosis in the circulation of selected tb positive sera samples. The study further identified the low abundant and high abundant biomarkers of tuberculosis. The detection of characterized low abundant biomarkers may help in identifying the disease in sputum smear negative cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,104
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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