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Enregistrement W2429162459 · doi:10.1038/ncomms11866

A CD36 ectodomain mediates insect pheromone detection via a putative tunnelling mechanism

2016· article· en· W2429162459 sur OpenAlexafffund
Carolina Gomez‐Diaz, Benoîte Bargeton, Liliane Abuin, Natalia Bukar, Tudor Bartoi, Marion Graf, Huy Ong, Maximilian H. Ulbrich, Jean‐François Masson, Richard Benton

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFundación para el Fomento en Asturias de la Investigación Científica Aplicada y la TecnologíaCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de LausanneSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésEctodomainMechanism (biology)PheromoneInsectBiologyCell biologyGeneticsEcologyPhysicsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CD36 transmembrane proteins have diverse roles in lipid uptake, cell adhesion and pathogen sensing. Despite numerous in vitro studies, how they act in native cellular contexts is poorly understood. A Drosophila CD36 homologue, sensory neuron membrane protein 1 (SNMP1), was previously shown to facilitate detection of lipid-derived pheromones by their cognate receptors in olfactory cilia. Here we investigate how SNMP1 functions in vivo. Structure-activity dissection demonstrates that SNMP1's ectodomain is essential, but intracellular and transmembrane domains dispensable, for cilia localization and pheromone-evoked responses. SNMP1 can be substituted by mammalian CD36, whose ectodomain can interact with insect pheromones. Homology modelling, using the mammalian LIMP-2 structure as template, reveals a putative tunnel in the SNMP1 ectodomain that is sufficiently large to accommodate pheromone molecules. Amino-acid substitutions predicted to block this tunnel diminish pheromone sensitivity. We propose a model in which SNMP1 funnels hydrophobic pheromones from the extracellular fluid to integral membrane receptors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,517

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations145
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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