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Enregistrement W2429788321 · doi:10.1385/0-89603-375-9:309

Epitope Mapping of Protein Antigens by Expression-PCR (E-PCR)

2003· article· en· W2429788321 sur OpenAlexaff
David E. Lanar, Kevin C. Kain, Henry B. Burch

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein purification and stability
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeMolecular biologyLinear epitopeImmunoprecipitationBiologyEpitope mappingMonoclonal antibodyAmino acidFLAG-tagCloning (programming)GeneBiochemistryAntigenAntibodyFusion proteinRecombinant DNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is often the case that one has a cloned gene for a protein and a monoclonal antibody (MAb) that recognizes an epitope within that protein. Determination of the amino acid sequences constituting an epitope recognized by the MAb can be problematic. Producing ever and ever smaller fragments of the protein in vivo using expression systems, such as bacteria, yeast, or baculovirus, leads to problems of having the expression system influence the protein, i.e., correct folding, glycosylation, and degradation. In some cases, the foreign protein may in fact be toxic to the cell, thereby making synthesis impossible. In addition, each new fragment in the study has to be constructed, usually by PCR from the gene, cloned, and then sequenced to check for fidelity against the parent sequence to avoid PCR errors. To detect the newly expressed protein by immunoprecipitation, radiolabeled amino acids are usually incorporated into the new product, but at the same time this label goes into all other host proteins. This can be further complicated if MAb crossreactivity or coprecipitation occurs. Most of these problems can be avoided by epitope mapping using proteins synthesized by expression-PCR (E-PCR) (1). E-PCR is a rapid and simple method for the in vitro production of proteins without having to go through the rigors of cloning. The resulting radiochemically pure proteins are useful for a variety of purposes that include studies on the subunit structure of proteins, epitope mapping, and protein mutagenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,345
Score d'incertitude au seuil0,552

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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