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Enregistrement W2430288902

Identification of genes specifically expressed by human Müller cells by use of subtractive hybridization.

2007· article· en· W2430288902 sur OpenAlexaff
C. Lupien, Christian Salesse

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySuppression subtractive hybridizationGeneGeneticsExpressed sequence tagcDNA libraryComplementary DNAGenomic librarySequence analysisHuman genomeMolecular biologyGenomePeptide sequence
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Müller cells are the predominant type of glial cells in the retina. They play a critical role in the retina. The purpose of this study was to generate a profile of the genes specifically expressed by human retinal Müller cells and to identify genes that may be responsible for retinal diseases. METHODS: Subtractive hybridization is a method process by which two populations of mRNA are compared in order to obtain clones of genes expressed in one population but not in the other. A cDNA subtraction library was constructed using RNA isolated from human Müller cells and human astrocytes. PCR-select differential screening was used to further verify the differentially expressed cDNA clones. Positive clones were sequenced and analyzed using the NCBI BLASTN program to identify sequence homologies. RESULTS: We identified 194 clones specifically expressed in human Müller cells. Among these clones, 102 corresponded to known human genes. Of the remaining 94 clones, 75 corresponded to expressed sequence tags or genomic clones and 19 transcripts did not match with any sequence in databases, and are possibly novel genes. CONCLUSIONS: The analysis of the subtraction library revealed genes that are specifically expressed by human Müller cells. Some of these genes are unidentified, novel genes that are specific to Müller cells as determined by RT-PCR and Northern blot analyses. These novel genes thus represent candidate genes for retinal diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,342

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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