Identification of genes specifically expressed by human Müller cells by use of subtractive hybridization.
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Müller cells are the predominant type of glial cells in the retina. They play a critical role in the retina. The purpose of this study was to generate a profile of the genes specifically expressed by human retinal Müller cells and to identify genes that may be responsible for retinal diseases. METHODS: Subtractive hybridization is a method process by which two populations of mRNA are compared in order to obtain clones of genes expressed in one population but not in the other. A cDNA subtraction library was constructed using RNA isolated from human Müller cells and human astrocytes. PCR-select differential screening was used to further verify the differentially expressed cDNA clones. Positive clones were sequenced and analyzed using the NCBI BLASTN program to identify sequence homologies. RESULTS: We identified 194 clones specifically expressed in human Müller cells. Among these clones, 102 corresponded to known human genes. Of the remaining 94 clones, 75 corresponded to expressed sequence tags or genomic clones and 19 transcripts did not match with any sequence in databases, and are possibly novel genes. CONCLUSIONS: The analysis of the subtraction library revealed genes that are specifically expressed by human Müller cells. Some of these genes are unidentified, novel genes that are specific to Müller cells as determined by RT-PCR and Northern blot analyses. These novel genes thus represent candidate genes for retinal diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».