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Enregistrement W2430353806

A framework for quantitative assessment of Ki67 distribution in preneoplastic bronchial epithelial lesions.

2012· article· en· W2430353806 sur OpenAlexaff
Mehrnoush Khojasteh, Timon P.H. Buys, Jean LeRiche, Stephen Lam, Martial Guillaud, Calum MacAulay

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging and Pathology Studies
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPathologyDysplasiaImmunostainingEpitheliumStainingBiopsyProliferation MarkerSquamous metaplasiaHyperplasiaImmunohistochemistryBiologyMetaplasiaMedicine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Deregulated cell proliferation is a hallmark of cancer, and Ki67 immunostaining can be used to identify proliferating cells. Evaluation of cell proliferation may have utility as a biomarker of epithelial malignant transformation risk. To date, most analyses of Ki67 staining have been restricted to semiquantitative estimations of the degree of staining or the measurement of the fraction of Ki67-positive cells within the epithelium. We sought to develop a robust, objective means of quantitatively evaluating Ki67 immunostaining for lung precancerous lesions. STUDY DESIGN: We quantified the spatial distribution of Ki67-expressing cells within the epithelium by means of (1) a cell-based Voronoi tessellation and (2) a basement membrane-referenced distance transform. This was undertaken in a large cohort of 613 lung biopsy sections representing normal, hyperplasia, squamous metaplasia and mild, moderate and severe dysplasia. For each section 21 features quantifying different aspects of the Ki67 staining were calculated. Intraobserver and inter-observer variation were recorded for a subset of the biopsy sections. We examined the behavior of each feature with respect to histopathological grade. RESULTS: These measures demonstrated that proliferation is generally limited to layers 2, 3 and 4 of the epithelium (layer 1 being the basal layer). The proliferation in the basal layer is limited and does not increase with increasing grade of dysplasia. Interobserver and intraobserver effects on these features were assessed, and several were more robust with respect to measuring Ki67 expression pattern than the commonly used fraction of Ki67-positive cells. CONCLUSION: Many of these quantitative features showed associations with histological grade that were as strong as the association that exists based on the fraction of Ki67-positive cells while being much more robust to interobserver- and intraobserver-associated variations. The measured spatial distribution of proliferating cells statistically demonstrated asymmetric cell division behavior in cells in the basal layer, a pattern attributed to stem cells giving rise to transient amplifying cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,018
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,041

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,018
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0060,003
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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