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Enregistrement W2431298502 · doi:10.1038/npjparkd.2016.4

SCARB2 variants and glucocerebrosidase activity in Parkinson’s disease

2016· article· en· W2431298502 sur OpenAlex
Roy N. Alcalay, Oren Levy, Pavlina Wolf, Petra Oliva, Xiaokui Kate Zhang, Cheryl Waters, Stanley Fahn, Un Jung Kang, Christopher Liong, Blair Ford, Pietro Mazzoni, Sheng‐Han Kuo, Amelie Johnson, Lan Xiong, Guy A. Rouleau, Wendy K. Chung, Karen Marder, Ziv Gan‐Or

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

Revuenpj Parkinson s Disease · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalInstitut universitaire en santé mentale de MontréalInstitut Universitaire de Gériatrie de MontréalUniversité de MontréalInstitut Universitaire en Santé Mentale de Québec
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of HealthParkinson's Disease FoundationBrookdale Foundation
Mots-clésGlucocerebrosidaseSingle-nucleotide polymorphismGenotypeLRRK2Linkage disequilibriumParkinson's diseaseInternal medicineAlleleBiologyOdds ratioGenome-wide association studyGeneticsEndocrinologyDiseaseGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mutations in glucocerebrosidase ( GBA ) are a common risk factor for Parkinson's disease (PD). The scavenger receptor class B member 2 ( SCARB2 ) gene encodes a receptor responsible for the transport of glucocerebrosidase (GCase) to the lysosome. Two common SNPs in linkage disequilibrium with SCARB2 , rs6812193 and rs6825004, have been associated with PD and Lewy Body Disease in genome-wide association studies. Whether these SNPs are associated with altered glucocerebrosidase enzymatic activity is unknown. Our objective was to determine whether SCARB2 SNPs are associated with PD and with reduced GCase activity. The GBA gene was fully sequenced, and the LRRK2 G2019S and SCARB2 rs6812193 and rs6825004 SNPs were genotyped in 548 PD patients and 272 controls. GCase activity in dried blood spots was measured by tandem mass spectrometry. We tested the association between SCARB2 genotypes and PD risk in regression models adjusted for gender, age, and LRRK2 G2019S and GBA mutation status. We compared GCase activity between participants with different genotypes at rs6812193 and rs6825004. Genotype at rs6812193 was associated with PD status. PD cases were less likely to carry the T allele than the C allele (OR=0.71; P =0.004), but GCase enzymatic activity was similar across rs6812193 genotypes (C/C: 11.88 μmol/l/h; C/T: 11.80 μmol/l/h; T/T: 12.02 μmol/l/h; P =0.867). Genotype at rs6825004 was not associated with either PD status or GCase activity. In conclusion, our results support an association between SCARB2 genotype at rs6812193 and PD, but suggest that the increased risk is not mediated by GCase activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle