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Enregistrement W2432034468 · doi:10.1093/neuonc/now065.18

AT-19SYSTEMATIC RADIOLOGICAL PHENOTYPING OF ATYPICAL TERATOID RHABDOID TUMOURS USING LANGUAGE MODELLED MACHINE LEARNING APPROACHES

2016· article· en· W2432034468 sur OpenAlexaff
John‐Paul Kilday, Michal Zápotocký, John Keane, Dimitrios Karanopoulos, Suzanne Laughlin, Annie Huang, Stavros Stivaros

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRadiological weaponComputer scienceArtificial intelligenceNatural language processingMedicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Despite multiparametric MRI, uncertainty remains in the radiological phenotyping of intracranial tumours and their specific molecular subtype. We introduce a systematic, reproducible, descriptive imaging model that integrates MRI imaging metrics into one data repository. This dataset underpins a radiological decision support system (DSS) that informs on radiological phenotyping of childhood intracranial tumours and, we propose, informs on their underlying biological makeup. METHODS: Using atypical teratoid rhabdoid tumours (ATRTs) as a test case, a language based systematic analysis and scoring system modelled the imaging phenotype and was correlated with published transcriptional ATRT sub-grouping for each case. Machine learning techniques were employed to drive a classification DSS. RESULTS: In total 35 tumours were analysed of which 46% were male with an age range of 0.14 - 15.6 years. There were 16 supratentorial, 18 infratentorial and 1 spinal tumour. The descriptive model contained 30 major attributes which accommodated 127 variables giving just under 1 million variable permutations per patient. Multiple machine learning approaches were then employed for stratification into ASCL1 positive and negative subtypes. These techniques included neural networks, decision tree stratification, support vector machine analysis and Bayesian networks. CONCLUSIONS: This study presents the first systematic descriptive model of ATRTs integrating any radiological metric to drive a DSS for phenotyping the biological subset of the tumour type. Validation will require the analysis of larger numbers of scans from patients with tumours of known and unknown phenotype. These systems have significant potential as diagnostic and decision making clinical aids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,315
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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Résumé présentoui

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