Epigenetic perspective into head and neck cancer through in silico gene expression profiling of histone lysine methyltransferases.
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To investigate the role of histone lysine methylation in normal and cancerous head and neck tissues, which will provide novel insight into the pathophysiology of oncogenesis in these tissues. DESIGN: Gene expression profiles from histone lysine methyltransferases (HKMTases) were obtained from UniGene expressed sequence tags (ESTs). HKMTase expression levels in respective tissues were analyzed for elevated expression or altered levels of normal versus human cancers. SETTING: UniGene EST data were derived from normal and cancerous human tissues submitted to UniGene. METHODS: The expression levels of 47 HKMTases were obtained for 46 normal and 25 cancerous tissues, which included 10 normal and 5 cancerous head and neck tissues. An analysis of expression levels was carried out to identify HKMTases with tissue-specific expression and alteration in head and neck cancer. MAIN OUTCOME MEASURES: Expression levels of HKMTases in normal and cancerous tissues of the head and neck in comparison with other anatomic sites. RESULTS: In 7 of 10 head and neck tissues, we identified HKMTases that were specifically elevated in these tissues in comparison with all 46 normal tissues. In all five head and neck cancers, we identified HKMTases specifically elevated in these tumours. In addition, we identitified HKMTases with altered expression in tumour versus normal head and neck tissues. CONCLUSIONS: Normal head and neck tissues have unique epigenetic profiles demarcated by distinct HKMTase gene expression. We identified HKMTases as potentially tissue-specific epigenetic regulators of the head and neck, which could behave as oncogenes or tumour suppressor genes important in malignant transformation of these tissues.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».