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Enregistrement W2434795545 · doi:10.1097/pai.0000000000000388

The Role of SATB2 as a Diagnostic Marker of Sinonasal Intestinal-type Adenocarcinoma

2016· article· en· W2434795545 sur OpenAlexaff
Alena Skálová, Aylin Sar, Ján Laco, Alena Metelková, Markéta Miesbauerová, Petr Šteiner, Marián Švajdler, Michal Michal

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Surgical Oncology
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCDX2KRASPathologyMedicineAdenocarcinomaNeuroblastoma RAS viral oncogene homologImmunohistochemistryNasal cavityColorectal cancerCancerInternal medicineBiologyGeneGene expressionAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Intestinal-type adenocarcinoma (ITAC) of the nasal cavity and paranasal sinuses is an uncommon tumor associated with exposure to wood and leather dust, nickel, and possibly smoking. ITAC shares phenotypical features with colorectal carcinoma. In contrast to most non-intestinal-type sinonasal adenocarcinomas, ITAC is an aggressive adenocarcinoma with poor clinical outcome; therefore, its reliable separation from non-ITAC is very important. AIM: The use of a combination of immunohistochemical markers of intestinal differentiation was tested in a cohort of sinonasal carcinomas of different types. The aim of this study was to explore a new intestinal marker, SATB2, in conjunction with CDX2 and CK20 in differential diagnosis of sinonasal adenocarcinomas. MATERIALS AND METHODS: Seven ITACs, 66 non-ITACs, and 1 case of extensive intestinal metaplasia (IM) of the nasal mucosa were included in the study and stained with SATB2, CK20, CDX2, and CK7 antibodies. Detection of mismatch repair proteins was performed in all cases of ITAC. All 7 sinonasal ITACs have been tested for KRAS, NRAS, and BRAF gene mutations. RESULTS: All ITACs showed positive expression for SATB2, whereas all non-ITAC cases were negative. The only 1 case of IM was found to be positive for SATB2, whereas the same case showed negative expression of CK20 and only focal immunostaining for CDX2. The genetic analysis showed that only 1 sinonasal ITAC (1/7) showed KRAS c.35G>C, p.(Gly12Ala) mutation, whereas BRAF and NRAS genes were wild type. Four ITACs revealed wild-type KRAS, NRAS, and BRAF, and 2 remaining cases were not analyzable. All ITACs showed preserved nuclear expression of mismatch repair proteins. CONCLUSIONS: SATB2 in combination with CDX2 and CK20 differentiates sinonasal ITAC from non-ITAC with increased diagnostic sensitivity and specificity and detects IM in the sinonasal tract more easily.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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