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Enregistrement W2434976182 · doi:10.1093/neuonc/now076.99

MB-104GENETIC PREDICTORS OF INTELLECTUAL OUTCOME IN CHILDREN TREATED FOR MEDULLOBLASTOMA

2016· article· en· W2434976182 sur OpenAlexaff
Adeoye Oyefiade, Nadia Scantlebury, Nicole Law, Anna Goldenberg, Donald Mabbott

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiation Therapy and Dosimetry
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaOutcome (game theory)PediatricsMedicinePsychologyPathologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Advances in cancer treatment have led to improved survival rates for pediatric brain tumor patients. However, these treatments are toxic to healthy brain tissue, and many patients develop long-term neuropsychological deficits as a result1. There exists a large variability in outcome such that some patients develop functional deficits while others do not. Little is known about genetic factors that may predict better or worse outcome in these patients. We explored the relationship between two candidate genes, gluthathione S transferase (GST) and peroxisomal proliferator activated receptor (PPAR), and long-term intellectual outcome in a sample of medulloblastoma patients. METHODS: Germ-line DNA from blood samples of thirty-nine patients was sequenced using the Illumina Human Omni2.5 BeadChip. Patients received tumor resection, craniospinal radiation, and multiagent chemotherapy as part of treatment. Intellectual outcome was assessed via the full scale intelligent quotient composite (FSIQ) from the Wechsler Intelligence scale for Children. A machine learning algorithm2 was used to explore the relationship between genes and intellectual outcome. RESULTS: We identified five polymorphisms on the PPARδ gene that were significantly associated with changes in intellectual outcome. Variant alleles predicted declines in intellectual functioning while wild-type or heterozygous alleles predicted a net-zero change. Our findings are consistent with recent studies suggesting a putative role for PPARδ in the regulation of injury-related neurotoxicity. DISCUSSION: PPARδ accounts for the variability in outcome in medulloblastoma survivors. Our results lay the foundation for animal studies investigating the molecular mechanisms by which PPARδ confers protection against the effects of treatment for brain tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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