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Enregistrement W2436647733 · doi:10.1093/cid/ciw370

Are We There Yet? Impact of the First International Standard for Cytomegalovirus DNA on the Harmonization of Results Reported on Plasma Samples

2016· article· en· W2436647733 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerial dilutionAmpliconCytomegalovirusMedicinePolymerase chain reactionGenotypeDNA extractionVirologyImmunologyInternal medicineBiologyVirusPathologyViral diseaseHerpesviridaeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Interassay harmonization of cytomegalovirus (CMV) DNA measurement is important for infection management. Uncertainty exists regarding the result harmonization achievable in patient plasma samples using quantitative polymerase chain reaction (qPCR) assays with calibrators now traceable to the First World Health Organization International Standard (IS) for CMV DNA. METHOD: Serial dilutions of the IS and a blinded panel of 40 genotyped CMV DNA-positive pooled plasma samples and 10 negative plasma samples were tested by 6 laboratories using 10 qPCR assays calibrated to the IS. Each clinical sample was constructed using plasma from a single unique transplant recipient. RESULTS: The variance for individual CMV DNA-positive samples was greater for clinical samples (median, 1.50 [range, 1.22-2.82] log10 IU/mL) than for IS dilutions (median, 0.94 [range, 0.69-1.35] log10 IU/mL) (P < .001); 58.9% of all clinical sample results and 93.6% of IS dilution results fell within ±0.5 log10 IU/mL of the mean viral load of each sample. Result variability was not impacted by either genotype or quantitative levels of CMV DNA. Testing procedure differences can significantly influence results, even when analyte-specific reagents are identical. For clinical samples, all assays demonstrated result bias (P < .008). Assays with amplicon sizes ≤86 bp had significantly higher results compared to assays with larger amplicon sizes (≥105 bp) (P < .001). CONCLUSIONS: The variability in CMV DNA results reported on individual samples has been reduced by the IS, but ongoing clinically relevant variability persists, preventing meaningful interassay result comparison.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,123
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle