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Enregistrement W2437211204 · doi:10.1186/s40168-016-0174-1

Host species identity, site and time drive temperate tree phyllosphere bacterial community structure

2016· article· en· W2437211204 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueMicrobiome · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversité du Québec en OutaouaisUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésPhyllosphereBiologyEcologyHost (biology)Temperate rainforestTemperate forestCommunity structureTemperate climateEpiphyteEcosystemBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The increasing awareness of the role of phyllosphere microbial communities in plant health calls for a greater understanding of their structure and dynamics in natural ecosystems. Since most knowledge of tree phyllosphere bacterial communities has been gathered in tropical forests, our goal was to characterize the community structure and assembly dynamics of phyllosphere epiphytic bacterial communities in temperate forests in Quebec, Canada. We targeted five dominant tree species: Acer saccharum, Acer rubrum, Betula papyrifera, Abies balsamea, and Picea glauca. We collected 180 samples of phyllosphere communities on these species at four natural forest sites, three times during the growing season. RESULTS: Host functional traits (i.e., wood density, leaf nitrogen content) and climate variables (summer mean temperature and precipitation) were strongly correlated with community structure. We highlight three key findings: (1) temperate tree species share a "core microbiome"; (2) significant evolutionary associations exist between groups of bacteria and host species; and (3) a greater part of the variation in phyllosphere bacterial community assembly is explained by host species identity (27 %) and species-site interaction (14 %), than by site (11 %) or time (1 %). CONCLUSIONS: We demonstrated that host species identity is a stronger driver of temperate tree phyllosphere bacterial communities than site or time. Our results suggest avenues for future studies on the influence of host functional traits on phyllosphere community functional biogeography across terrestrial biomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,530
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle