Polarizable Force Field with a σ-Hole for Liquid and Aqueous Bromomethane
Notice bibliographique
Résumé
Bromomethane (CH3Br) is an acutely toxic environmental pollutant that contributes to ozone depletion. Molecular simulation could be a valuable tool for studying its partitioning and transport in the environment if an accurate molecular model was available. The generalized Amber force field (GAFF), OPLS (optimized potentials for liquid simulations) force field, and CHARMM general force field (CGenFF) were tested for their ability to model the physical properties of liquid bromomethane. The OPLS force field was in fairly good agreement with experiment, while CGenFF and GAFF were significantly in error. The Br Lennard-Jones parameters of the GAFF and CGenFF models were reparameterized, but their radial distribution functions still have significant deviations from those calculated by ab initio molecular dynamics (AIMD). A Drude polarizable force field for bromomethane was parametrized with an off-center positively charged site to represent the C-Br σ-hole. This model is in good agreement with the bulk physical properties and the AIMD RDFs. The modest solubility of bromomethane was reproduced by this model, with dispersion interactions being the dominant water-solute interaction. The water-solute electrostatic interactions are a smaller factor in solubility. This model predicts bromomethane to have a 13 kJ mol(-1) surface excess potential at the water-vapor interface.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».