The determination of standard metabolic rate in fishes
Notice bibliographique
Résumé
This review and data analysis outline how fish biologists should most reliably estimate the minimal amount of oxygen needed by a fish to support its aerobic metabolic rate (termed standard metabolic rate; SMR). By reviewing key literature, it explains the theory, terminology and challenges underlying SMR measurements in fishes, which are almost always made using respirometry (which measures oxygen uptake, ṀO2 ). Then, the practical difficulties of measuring SMR when activity of the fish is not quantitatively evaluated are comprehensively explored using 85 examples of ṀO2 data from different fishes and one crustacean, an analysis that goes well beyond any previous attempt. The main objective was to compare eight methods to estimate SMR. The methods were: average of the lowest 10 values (low10) and average of the 10% lowest ṀO2 values, after removing the five lowest ones as outliers (low10%), mean of the lowest normal distribution (MLND) and quantiles that assign from 10 to 30% of the data below SMR (q0·1 , q0·15 , q0·2 , q0·25 and q0·3 ). The eight methods yielded significantly different SMR estimates, as expected. While the differences were small when the variability was low amongst the ṀO2 values, they were important (>20%) for several cases. The degree of agreement between the methods was related to the c.v. of the observations that were classified into the lowest normal distribution, the c.v. MLND (C.V.MLND ). When this indicator was low (≤5·4), it was advantageous to use the MLND, otherwise, one of the q0·2 or q0·25 should be used. The second objective was to assess if the data recorded during the initial recovery period in the respirometer should be included or excluded, and the recommendation is to exclude them. The final objective was to determine the minimal duration of experiments aiming to estimate SMR. The results show that 12 h is insufficient but 24 h is adequate. A list of basic recommendations for practitioners who use respirometry to measure SMR in fishes is provided.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».