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Enregistrement W2444314350 · doi:10.3732/ajb.1600113

Most Compositae (Asteraceae) are descendants of a paleohexaploid and all share a paleotetraploid ancestor with the Calyceraceae

2016· article· en· W2444314350 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Botany · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSesquiterpenes and Asteraceae Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAncestorAsteraceaeLineage (genetic)PolyploidEvolutionary biologyMost recent common ancestorPhylogeneticsPhylogenomicsGenomeBotanyGeneticsGeneClade

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PREMISE OF THE STUDY: Like many other flowering plants, members of the Compositae (Asteraceae) have a polyploid ancestry. Previous analyses found evidence for an ancient duplication or possibly triplication in the early evolutionary history of the family. We sought to better place this paleopolyploidy in the phylogeny and assess its nature. METHODS: We sequenced new transcriptomes for Barnadesia, the lineage sister to all other Compositae, and four representatives of closely related families. Using a recently developed algorithm, MAPS, we analyzed nuclear gene family phylogenies for evidence of paleopolyploidy. KEY RESULTS: We found that the previously recognized Compositae paleopolyploidy is also in the ancestry of the Calyceraceae. Our phylogenomic analyses uncovered evidence for a successive second round of genome duplication among all sampled Compositae except Barnadesia. CONCLUSIONS: Our analyses of new samples with new tools provide a revised view of paleopolyploidy in the Compositae. Together with results from a high density Lactuca linkage map, our results suggest that the Compositae and Calyceraceae have a common paleotetraploid ancestor and that most Compositae are descendants of a paleohexaploid. Although paleohexaploids have been previously identified, this is the first example where the paleotetraploid and paleohexaploid lineages have survived over tens of millions of years. The complex polyploidy in the ancestry of the Compositae and Calyceraceae represents a unique opportunity to study the long-term evolutionary fates and consequences of different ploidal levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,630
Score d'incertitude au seuil0,359

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle