<i>ERG11</i> mutations and upregulation in clinical itraconazole-resistant isolates of <i>Candida krusei</i>
Notice bibliographique
Résumé
To better understand the association between the ERG11 gene and drug resistance in Candida krusei, C. krusei strains were isolated from patients from January 2010 to May 2013. Susceptibility to 5-fluorocytosine (5-FC), amphotericin B (AMB), voriconazole (VRC), fluconazole (FLC), and itraconazole (ITR) were tested by broth microdilution method. Mutations were detected using PCR amplification and gene sequencing. Expression levels of ERG11 were measured by real-time PCR and compared by a 2-tailed Student's t test between ITR-susceptible strains and ITR-resistant strains. In total, 15 C. krusei strains were obtained, of which 20.00%, 53.33%, and 40.00% were resistant to 5-FC, FLC, and ITR, respectively, whereas all isolates were susceptible to AMB and VRC. Three synonymous codon substitutions were found in ERG11, including T939C, T642C, and A756T. However, T939C was found in both resistant and susceptible C. krusei strains. The expression level of ERG11 was significantly higher in resistant C. krusei strains (1.34 ± 0.08) than in susceptible C. krusei strains (0.94 ± 0.14) (t = 3.74, p < 0.05). Our study demonstrates that point mutations (T642C and A756T) accompanied with the overexpression of ERG11 might be involved in the molecular mechanisms of drug resistance in C. krusei.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».