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Enregistrement W2460815605 · doi:10.15171/jarcm.2016.014

Analysis of colorectal cancer and polyp for presence herpes simplex virus and cytomegalovirus DNA sequences by polymerase chain reaction

2016· article· en· W2460815605 sur OpenAlexaboutno aff
Sahar Mehrabani-Khasraghi, Mitra Ameli, Farzad Khalily

Notice bibliographique

RevueJournal of Analytical Research in Clinical Medicine · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHerpes simplex virusPolymerase chain reactionCytomegalovirusVirologyColorectal cancerDNAColorectal PolypHerpesviridaePolymeraseMedicineVirusBiologyCancerGeneticsViral diseaseGeneColonoscopy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction:In recent years, it was demonstrated that there is a clear association between the complicated course of colorectal cancer (CRC) and the presence of herpes viruses.Despite a great number of published reports, the exact pathogenic role of herpes viruses remains unclear in these patients.The purpose of this study is to explore the prevalence of herpes simplex virus (HSV) and cytomegalovirus (CMV) in patients with CRC and polyp in comparison with healthy subjects using the polymerase chain reaction (PCR) method.Methods: In this case-control study, 15 biopsies of patients with CRC and 20 colorectal polyp sample were selected.From each patient, two tissue samples were obtained: one sample from malignant tissue, and the other from normal colorectal tissue in an area located 15 cm away from the malignant tissue.Furthermore, 35 samples from healthy people as controls were selected.After DNA extraction, PCR was used to determine HSV and CMV genomes by specific primers.A statistical analysis was performed using the chi-square test.Results: Five CRC patients (33.3%) had HSV DNA detected in both the malignant and the matched normal tissue.Five CRC patients (33.3%) and seven polyp patients (35.0%) had CMV DNA detected in both the malignant and the matched normal tissue.HSV DNA was found in 20% and CMV DNA in 37.1% of samples from healthy people as a control group.Thus, no significant association was observed between the prevalence of HSV and CMV, and an incidence of CRC and polyps according to the location of the samples as compared with the control group.Conclusion: The findings demonstrated that there is no direct molecular evidence to support the association between HSV and CMV and human colorectal malignancies.However, the results from this study do not exclude a possible oncogenic role of these viruses in the neoplastic development of colon cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,159
Tête enseignante GPT0,511
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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