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Enregistrement W2461441315 · doi:10.1016/j.fgb.2016.07.006

Unh1, an Ustilago maydis Ndt80-like protein, controls completion of tumor maturation, teliospore development, and meiosis

2016· article· en· W2461441315 sur OpenAlexafffund
Colleen Doyle, H.Y. Kitty Cheung, Kelsey L. Spence, Barry Saville

Notice bibliographique

RevueFungal Genetics and Biology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensTrent University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésUstilagoBiologyMeiosisEctopic expressionCell biologyTranscription (linguistics)Transcription factorGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study, Ustilago maydis Ndt80 homolog one, unh1, of the obligate sexual pathogen U. maydis,is described. Unh1 is the sole Ndt80-like DNA-binding protein inU. maydis. In this model basidiomycete, Unh1 plays a role in sexual development, influencing tumor maturation, teliospore development and subsequent meiotic completion. Teliospore formation was reduced in deletion mutants, and those that did form had unpigmented, hyaline cell walls, and germinated without completing meiosis. Constitutively expressing unh1 in haploid cells resulted in abnormal pigmentation, when grown in both potato dextrose broth and minimal medium, suggesting that pigmentation may be triggered by unh1 in U. maydis. The function of Unh1 in sexual development and pigment production depends on the presence of the Ndt80-like DNA-binding domain, identified within Unh1. In the absence of this domain, or when the binding domain was altered with targeted amino acid changes, ectopic expression of Unh1 failed to complement the unh1 deletion with regards to pigment production and sexual development. An investigation of U. maydis genes with upstream motifs similar to Ndt80 recognition sequences revealed that some have altered transcript levels in Δunh1 strains. We propose that the first characterized Ndt80-like DNA-binding protein in a basidiomycete, Unh1, acts as a transcription factor that is required for teliospore maturation and the completion of meiosis in U. maydis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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