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Enregistrement W2461495609 · doi:10.1186/s12866-016-0749-9

Temporal trends and risks factors for antimicrobial resistant Enterobacteriaceae urinary isolates from outpatients in Guadeloupe

2016· article· en· W2461495609 sur OpenAlexaff
Stéphanie Guyomard-Rabenirina, Joyce Malespine, Célia Ducat, Syndia Sadikalay, Mélanie Falord, Dorothée Harrois, Vincent Richard, Charles M. Dozois, Sébastien Breurec, Antoine Talarmin

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUrinary Tract Infections Management
Établissements canadiensArmand Frappier MuseumInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésCiprofloxacinMicrobiologyAntibiotic resistanceEnterobacteriaceaeCephalosporinBiologyAmoxicillinAntibioticsKlebsiella pneumoniaeMedicineEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Urinary tract infections are bacterial infections most commonly encountered in the community. The resistance rate of uropathogens to commonly prescribed antibiotics has increased worldwide but there are no published data concerning the resistance of strains isolated from community-acquired UTI in Guadeloupe. To assess the susceptibility patterns of Enterobacteriaceae strains isolated from outpatients in Guadeloupe we conducted a prospective study from December 2012 to May 2014 among outpatients consulting at private and public laboratories for urine analysis. Risk factors for E. coli resistance to amoxicillin, third-generation cephalosporin, and ciprofloxacin were also determined. To study the trends of E. coli resistance rates over the past 10 years, data on the susceptibility patterns of E. coli from 2003 to 2014 were also collected from three major laboratories for a retrospective study. RESULTS: During the prospective study, we isolated 1293 bacterial strains from the urine of outpatients presenting for urine analysis. The most commonly isolated bacteria were E. coli (57 %) and Klebsiella pneumoniae (15.5 %). Thirty seven per cent of the E. coli strains were resistant to amoxicillin. Resistance rates to third generation cephalosporin were low for E. coli and other Enterobacteriaceae (3.1 and 12.2 % respectively) and mostly due to the presence of an Extended Spectrum Beta-lactamase. Resistance to cotrimoxazole and ciprofloxacin was moderate (17.8 and 15.6 % respectively). However, the resistance rate of E. coli to ciprofloxacin has significantly increased during the last 10 years. Risk factors were consistent with previously reported data, especially for the increasing ciprofloxacin resistance with age. CONCLUSION: General practitioners in Guadeloupe need to be better informed to favor the prescription of fosfomycin-trometamol to reduce the risk of resistance to fluoroquinolones.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,300
Score d'incertitude au seuil0,693

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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