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Enregistrement W2461686874 · doi:10.1007/978-1-59259-993-6_12

New Approaches to Fluorescence In Situ Hybridization

2006· article· en· W2461686874 sur OpenAlexaff
Sabita K. Murthy, Douglas J. Demetrick

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFluorescence in situ hybridizationComparative genomic hybridizationFish <Actinopterygii>BiologyKaryotypeCytogeneticsHybridization probeIn situ hybridizationComputational biologyMolecular cytogeneticsIn situInterphaseChromosomeDNAGeneticsGeneChemistryFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fluorescence in situ hybridization (FISH) is a nonisotopic labeling and detection method that provides a direct way to determine the relative location or copy number of specific DNA sequences in nuclei or chromosomes. With recent advancements, this technique has found increased application in a number of research areas, including cytogenetics, prenatal diagnosis, cancer research and diagnosis, nuclear organization, gene loss and/or amplification, and gene mapping. The availability of different types of probe and the increasing number of FISH techniques has made it a widespread and diversely applied technology. Multicolor karyotyping by multicolor FISH and spectral karyotyping interphase FISH and comparative genomic hybridization allow genetic analysis of previously intractable targets. We present a brief overview of FISH technology and describe in detail methods of probe labeling and detection for different types of tissue sample, including microdissected nuclei from formalin-fixed paraffin-embedded tissue sections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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