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Enregistrement W2461767701 · doi:10.1118/1.4955563

SU‐C‐BRA‐02: A Lung Tumor Autocontouring Algorithm Based On Particle Filter for Dynamic Magnetic Resonance

2016· article· en· W2461767701 sur OpenAlexaff
Alexandra E Bourque, Stéphane Bedwani, Édith Filion, Jean‐François Carrier

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAdvanced Image and Video Retrieval Techniques
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésContouringMagnetic resonance imagingNuclear medicineThresholdingContext (archaeology)CentroidArtificial intelligenceAlgorithmMathematicsPhysicsComputer scienceMedicineImage (mathematics)Radiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: This study proposes a novel autocontouring algorithm for lung tumors based on particle filter. It is developed in the context of MR‐linac treatments and is validated on in‐vivo dynamic magnetic resonance images. Methods: A sequential Monte Carlo method called particle filter is combined with Otsu's thresholding technique to contour lung tumors on dynamic MR images. Four non‐small cell lung cancer (NSCLC) patients were imaged with a 1.5 T MR (MAGNETOM Aera, Siemens Healthcare, Erlangen, Germany) for one minute at a rate of 4 images per second. A pretreatment image‐processing step includes a manual contour of the tumor, the tumor's displacement, and its descriptive statistics. During treatment, the contours are automatically generated by thresholding the image in a window surrounding the center of mass of the particles. The Dice similarity coefficient (DSC), the precision, the recall, the Hausdorff distance (HD) and the difference in centroid positions (Δd) are calculated to compare with the expert's contours. Results: This autocontouring algorithm presents continuous adaptability and is independent of pre‐treatment training. The number of particles is proportional to the area of the tumor and increases the computational time at a rate of 2 ms for every 500 particles, whereas the contouring step adds a constant 14 ms. The contours’ comparison is obtained with a mean DSC of 0.89 to 0.91, mean precision of 0.88 to 0.92, mean recall of 0.88 to 0.95 and mean Δd of 0.6 to 2.3 mm. Conclusion: This work presents a new autocontouring algorithm for NSCLC patients on dynamic MR images. Combining the autocontours with a motion prediction algorithm presents a promising method for lung tumor online tracking treatments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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Résumé présentoui

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