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Enregistrement W2461905241 · doi:10.1093/ofid/ofv133.1348

An Outbreak of NDM-1 Klebsiella pneumoniae in a Tertiary Care Hospital in British Columbia: The Role of Molecular Analysis in Determining Transmission

2015· article· en· W2461905241 sur OpenAlexaffabout
Manal Tadros, Linda Hoang, Matthew A. Croxen, Michael R. Mulvey, Benjamin Mack, Susan Roman, J. Bruce Tomblin, Elizabeth Brodkin, Adriana Carla Rodrigues Mendes, Ken Fakharuddin, Suk Ching Wong, Dale Purych

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensFraser Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKlebsiella pneumoniaeOutbreakMedicineTransmission (telecommunications)Tertiary careKlebsiellaPathogenic organismUniversity hospitalVirologyMicrobiologyFamily medicineEscherichia coliTelecommunicationsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. Carbapenemase-producing organisms (CPO) are considered a growing healthcare problem. We are reporting an outbreak of a New Delhi metallo-β-lactamase (NDM-1) producing Klebsiella pneumoniae that occurred at a major tertiary care facility in British Columbia from November 2013 to March 2014. Methods. Gram-negative bacilli from clinical and surveillance specimens were tested for carbapenem susceptibility by VITEK 2. Carbapenem non-susceptible organisms were further tested by E-test and ROSCO Neo-Sensitabs. PCR for carbapenemase genes was done on all carbapenem non-susceptible isolates. Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) was performed on the isolates. Plasmid restriction fragment length polymorphism (RFLP) was done for carbapenemase producing plasmids using BglII. Results. A total of eleven patients were considered part of the K. pneumoniae NDM-1 outbreak on a medical unit. PFGE showed that the patients' isolates had 2 main clonal patterns. Plasmid analysis by PCR and RFLP was done and showed that 10 of the 11 cases had an NDM plasmid that belonged to the same major cluster (pNDM-BC-5). Two ICU patients had NDM-1 producing K. pneumoniae in clinical isolates but the plasmid belonged to a different major cluster (pNDM-BC-7) and they were not considered part of the outbreak. All patients colonized or infected with NDM producing K. pneumoniae were placed on contact precautions in single rooms. All positive patients were cohorted to one side of the outbreak unit. Nursing staff were also cohorted into a clean cohort and an outbreak cohort. Weekly point prevalence screens were conducted. Targeted surveillance of all admitted patients was started in March 2014 within all hospitals in the health authority. These combined measures resulted in halting transmission and the outbreak was declared over on March 10, 2014. Conclusion. Institutions that serve populations who frequently travel to regions where carbapenemase-producing organisms are endemic should have a robust surveillance and containment system for these organisms. Active surveillance and staff cohorting are important infection control measures. Molecular tools are helpful in understanding the patterns of transmission of these organisms and assisting with control measures. Disclosures. All authors: No reported disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,221
Score d'incertitude au seuil0,444

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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