Inflated organelle genomes and a circular-mapping mtDNA probably existed at the origin of coloniality in volvocine green algae
Notice bibliographique
Résumé
The volvocine lineage is a monophyletic grouping of unicellular, colonial and multicellular algae, and a model for studying the evolution of multicellularity. In addition to being morphologically diverse, volvocine algae boast a surprising amount of organelle genomic variation. Moreover, volvocine organelle genome complexity appears to scale positively with organismal complexity. However, the organelle DNA architecture at the origin of colonial living is not known. To examine this issue, we sequenced the plastid and mitochondrial DNAs (ptDNA and mtDNA) of the 4-celled alga Tetrabaena socialis, which is basal to the colonial and multicellular volvocines.Tetrabaena socialis has a circular-mapping mitochondrial genome, contrasting with the linear mtDNA architecture of its relative Chlamydomonas reinhardtii. This suggests that a circular-mapping mtDNA conformation emerged at or near the transition to group living in the volvocines, or represents the ancestral state of the lineage as a whole. The T. socialis ptDNA is very large (>405 kb) and dense with repeats, supporting the idea that a shift from a unicellular to a colonial existence coincided with organelle genomic expansion, potentially as a result of increased random genetic drift. These data reinforce the idea that volvocine algae harbour some of the most expanded plastid chromosomes from the eukaryotic tree of life. Circular-mapping mtDNAs are turning out to be more common within volvocines than originally thought, particularly for colonial and multicellular species. Altogether, volvocine organelle genomes became markedly more inflated during the evolution of multicellularity, but complex organelle genomes appear to have existed at the very beginning of colonial living.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».