Effect of temperature on <scp>G</scp>a<scp>RV</scp>6 accumulation and its fungal host, the conifer pathogen <i>Gremmeniella abietina</i>
Notice bibliographique
Résumé
Summary Gremmeniella abietina RNA virus 6 (GaRV6) was studied within the European race of G. abietina. We examined 97 isolates originating from Canada, Czech Republic, Finland, Italy, Montenegro, Serbia, Spain, Switzerland, Turkey and the United States. According to direct specific quantitative reverse transcription PCR (qRT‐PCR) screening based on the RNA‐dependent RNA polymerase (RdRp) sequence, the virus was mostly present in Spain, but it was also found at a very low concentration in three isolates from Canada, Italy and Finland. To gain insight into the three‐way interaction among temperature, GaRV6 and G. abietina, we performed an in vitro experiment with eight Spanish isolates (four infected and four uninfected) with four repetitions each. We assessed the virus expression (accumulation) based on the quantity of RdRp‐encoding RNA by qRT‐PCR and the G. abietina growth rate at 5, 15 and 20°C. The presence of the virus had a significant negative effect on the G. abietina growth rate, which was also significantly influenced by the temperature. However, the temperature appeared not to clearly determine the virus accumulation, and the virus accumulation did not have any influence on the growth rate of the infected G. abietina isolates. Taken together, these results suggest that the role of this virus as a relevant factor with respect to the more thermophilic nature of the Spanish population of G. abietina may be ruled out.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».