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Enregistrement W2463313676 · doi:10.1111/efp.12291

Effect of temperature on <scp>G</scp>a<scp>RV</scp>6 accumulation and its fungal host, the conifer pathogen <i>Gremmeniella abietina</i>

2016· article· en· W2463313676 sur OpenAlexaboutno aff
Leticia Botella, Miloň Dvořák, Paolo Capretti, Nicola Luchi

Notice bibliographique

RevueForest Pathology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Interactions Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean Social Fund
Mots-clésBiologyVirusPathogenRNA polymeraseHost (biology)PopulationRNAMicrobiologyVirologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Gremmeniella abietina RNA virus 6 (Ga RV 6) was studied within the European race of G. abietina . We examined 97 isolates originating from Canada, Czech Republic, Finland, Italy, Montenegro, Serbia, Spain, Switzerland, Turkey and the United States. According to direct specific quantitative reverse transcription PCR ( qRT ‐ PCR ) screening based on the RNA ‐dependent RNA polymerase (RdRp) sequence, the virus was mostly present in Spain, but it was also found at a very low concentration in three isolates from Canada, Italy and Finland. To gain insight into the three‐way interaction among temperature, Ga RV 6 and G. abietina , we performed an in vitro experiment with eight Spanish isolates (four infected and four uninfected) with four repetitions each. We assessed the virus expression (accumulation) based on the quantity of RdRp‐encoding RNA by qRT ‐ PCR and the G. abietina growth rate at 5, 15 and 20°C. The presence of the virus had a significant negative effect on the G. abietina growth rate, which was also significantly influenced by the temperature. However, the temperature appeared not to clearly determine the virus accumulation, and the virus accumulation did not have any influence on the growth rate of the infected G. abietina isolates. Taken together, these results suggest that the role of this virus as a relevant factor with respect to the more thermophilic nature of the Spanish population of G. abietina may be ruled out.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,562

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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