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Enregistrement W2463358284 · doi:10.1186/s13148-016-0239-9

PPARGC1α gene DNA methylation variations in human placenta mediate the link between maternal hyperglycemia and leptin levels in newborns

2016· article· en· W2463358284 sur OpenAlexafffund
Sandra Côté, Valérie Gagné‐Ouellet, Simon‐Pierre Guay, Catherine Allard, Andrée-Anne Houde, Patrice Perron, Jean‐Patrice Baillargeon, Daniel Gaudet, Renée Guérin, Diane Brisson, Marie‐France Hivert, Luigi Bouchard

Notice bibliographique

RevueClinical Epigenetics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGestational Diabetes Research and Management
Établissements canadiensCégep de ChicoutimiCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanUniversité de MontréalUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de SherbrookeFonds de Recherche du Québec - SantéDiabète Québec
Mots-clésDNA methylationGestational diabetesPregnancyEndocrinologyInternal medicinePlacentaLeptinBiologyCord bloodEpigeneticsPRDM16ObesityMedicineFetusGeneGestationGeneticsBrown adipose tissueGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Children exposed to gestational diabetes mellitus (GDM) are at a higher risk of developing obesity and type 2 diabetes. This susceptibility might involve brown adipose tissue (BAT), which is suspected to protect against obesity. The objective of this study is to assess whether fetal exposure to maternal hyperglycemia is associated with DNA methylation variations in genes involved in BAT genesis and activation. METHODS: DNA methylation levels at the PRDM16, BMP7, CTBP2, and PPARGC1α gene loci were measured in placenta samples using bisulfite pyrosequencing in E-21 (n = 133; 33 cases of GDM) and the HumanMethylation450 array in Gen3G (n = 172, all from non-diabetic women) birth cohorts. Glucose tolerance was assessed in all women using an oral glucose tolerance test at the second trimester of pregnancy. Participating women were extensively phenotyped throughout pregnancy, and placenta and cord blood samples were collected at birth. RESULTS: We report that maternal glycemia at the second and third trimester of pregnancy are correlated with variations in DNA methylation levels at PRDM16, BMP7, and PPARGC1α and with cord blood leptin levels. Variations in PRDM16 and PPARGC1α DNA methylation levels were also correlated with cord blood leptin levels. Mediation analyses support that DNA methylation variations at the PPARGC1α gene locus explain 0.8 % of the cord blood leptin levels variance independently of maternal fasting glucose levels (p = 0.05). CONCLUSIONS: These results suggest that maternal glucose in pregnancy could produce variations in DNA methylation in BAT-related genes and that some of these DNA methylation marks seem to mediate the impact of maternal glycemia on cord blood leptin levels, an adipokine regulating body weight.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,099
Tête enseignante GPT0,403
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations104
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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