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Enregistrement W2464134108 · doi:10.2217/epi-2016-0007

Phenotypic Spectrum and Extent of DNA Methylation Defects Associated with Multilocus Imprinting Disturbances

2016· article· en· W2464134108 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueEpigenomics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Genetics
Mots-clésBiologyImprinting (psychology)DNA methylationGeneticsPhenotypeGenomic imprintingEpigeneticsMethylationDNAComputational biologyEvolutionary biologyGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: To characterize the genotypic and phenotypic extent of multilocus imprinting disturbances (MLID). MATERIALS & METHODS: We analyzed 37 patients with imprinting disorders (explorative cohort) for DNA methylation changes using the Infinium HumanMethylation450 BeadChip. For validation, three independent cohorts with imprinting disorders or cardinal features thereof were analyzed (84 patients with imprinting disorders, 52 with growth disorder, 81 with developmental delay). RESULTS: In the explorative cohort 21 individuals showed array-based MLID with each one displaying an Angelman or Temple syndrome phenotype, respectively. Epimutations in ZDBF2 and FAM50B were associated with severe MLID regarding number of affected regions. By targeted analysis we identified methylation changes of ZDBF2 and FAM50B also in the three validation cohorts. CONCLUSION: We corroborate epimutations in ZDBF2 and FAM50B as frequent changes in MLID whereas these rarely occur in other patients with cardinal features of imprinting disorders. Moreover, we show cell lineage specific differences in the genomic extent of FAM50B epimutation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,417
Score d'incertitude au seuil0,307

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle