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Enregistrement W2465126308 · doi:10.1089/vbz.2015.1935

Virulence Genes and the Antimicrobial Susceptibility of <i>Escherichia coli</i> , Isolated from Wild Waterbirds, in the Netherlands and Poland

2016· article· en· W2465126308 sur OpenAlexaboutno aff
Maciej Kuczkowski, Marta Krawiec, Berend Voslamber, Marta Książczyk, Gabriela Płoskońska-Bugla, Alina Wieliczko

Notice bibliographique

RevueVector-Borne and Zoonotic Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNarodowe Centrum Badań i RozwojuNational Research Centre
Mots-clésVirulenceBiologyGooseBrantaEnrofloxacinCormorantEscherichia coliMicrobiologyTetracyclinePhylogenetic treeAntimicrobialVeterinary medicineAntibioticsGeneGeneticsCiprofloxacinEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Affiliation to four phylogroups (A, B1, B2, and D) was examined, among 190 Escherichia coli strains, collected from five, wild waterbird species, including the following: the Greylag goose-Anser anser (61) and the Canada goose-Branta canadensis (33) obtained in the Netherlands, and the Mallard-Anas platyrhynchos (38), the Mute swan-Cygnus olor (37), and the Great cormorant-Phalacrocorax carbo (21) obtained in Poland. Moreover, the prevalence of 10 virulence factors: astA, iss, iucD, irp2, papC, tsh, vat, cva/cvi, stx2f, and bfp, as well as antimicrobial susceptibility to amoxicillin, enrofloxacin, and tetracycline (minimum inhibitory concentration [MIC] using E-tests) were investigated, in the examined E. coli strains. Results demonstrated that the greatest number of E. coli strains belonged to phylogenetic groups, B1 (86 strains-45.3%) and D (49 strains-25.8%), whereas 40 (21.0%) and only 15 (7.9%) isolates were classified as being of phylogenetic groups, A and B2, respectively. Among the 10 tested virulence-associated genes, 7 genes were detected in 61 examined strains (32.1%) with highly varying frequency. Virulence profiles showed that astA, iss, and irp2 genes were detected most frequently among all examined E. coli strains, isolated from every chosen bird species. Antimicrobial susceptibility, as detected by MIC for the examined antibiotics, is variable among strains isolated from different species of birds. The aim of this study was to examine the prevalence of E. coli strains, isolated from different species of wild waterbirds and determine their potential pathogenicity to the environment, other birds, and people.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,634
Score d'incertitude au seuil0,303

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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