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Enregistrement W2465479990 · doi:10.1007/978-1-59745-030-0_12

Characterization of Cardiac Gene Promoter Activity

2007· article· en· W2465479990 sur OpenAlexaff
Hsiao‐Huei Chen, Alexandre F.R. Stewart

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPromoterGeneBiologyHeterologousReporter geneTranscription factorGene expressionTransfectionTranscription (linguistics)Context (archaeology)Heterologous expressionRegulation of gene expressionGeneticsCell biologyMolecular biologyRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cardiac gene promoter analysis remains an integral method in molecular cardiology and continues to provide novel insights into the transcriptional mechanisms that regulate gene expression in the myocardium. Initial studies focused on the regulated expression of contractile genes, since their transcripts are abundant and their cDNAs were among the first to be cloned. More recent studies have focused on the promoters of genes expressed at much lower levels, including those that encode ion channels, signaling proteins, and the cardiac transcription factors. The standard approach to analyze myocardial gene promoters has been to transfect reporter plasmids into cultured neonatal rat cardiac myocytes. This approach has the unique advantage of allowing the exploration of different signaling mechanisms by supplementing culture media with different agonists and inhibitors. In addition, cis-elements that control gene expression under different physiological stresses have been further characterized in the context of heterologous promoters to demonstrate their "stand-alone" functional properties in the absence of confounding influences from other cis-elements and their cognate transcription factors. Here we illustrate the characterization of cardiac gene promoter activity using reporter constructs and heterologous promoter studies in cultured cardiac myocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,633

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
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Résumé présentoui

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