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Enregistrement W2465591488 · doi:10.5740/jaoacint.15-0282

Method Modification Study for the Thermo Scientific SureTect™ Listeria Species Assay–Matrix Extension

2016· article· en· W2465591488 sur OpenAlexaffabout
Jonathan Cloke, Katharine Evans, David Crabtree, Annette Hughes, Helen Simpson, Jani Holopainen, Nina Wickstrand, Mikko Kauppinen, Carlos G. Leon-Velarde, Nathan Larson, Keron Dave, Yi Chen, Elliot T. Ryser, Mark Carter

Notice bibliographique

RevueJournal of AOAC International · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIdentification and Quantification in Food
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésListeriaPasteurizationFood scienceRaw materialCertified reference materialsChemistryEnvironmental scienceMathematicsListeria monocytogenesBiologyChromatographyDetection limitBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Thermo Scientific™ SureTect™ Listeria species assay is a new real-time PCR assay for the detection of all species of Listeria in food and environmental samples. The assay was originally certified as Performance Tested Methods(SM) (PTM) 071304 in 2013. This report details the method modification study undertaken to extend the performance claims of the assay for matrixes of raw ground turkey, raw ground pork, bagged lettuce, raw pork sausages, pasteurized 2% fat milk, raw cod, pasteurized brie cheese, and ice cream. The method modification study was conducted using the AOAC Research Institute (RI) PTM program to validate the SureTect PCR assay in comparison to the reference method detailed in ISO 11290-1:1996 including amendment 1:2004. All matrixes were tested by Thermo Fisher Scientific (Basingstoke, United Kingdom). In addition, three matrixes (raw cod, bagged lettuce, and pasteurized brie cheese) were analyzed independently as part of the AOAC RI-controlled independent laboratory study by the University of Guelph, Canada. Using probability of detection statistical analysis, there was no significant difference in the performance between the SureTect assay and the International Organization for Standardization reference method for any of the matrixes analyzed in this study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,031
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,082

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,031
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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Résumé présentoui

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