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Enregistrement W2466100069 · doi:10.1167/iovs.14-15751

Choroideremia Is a Systemic Disease With Lymphocyte Crystals and Plasma Lipid and RBC Membrane Abnormalities

2015· article· en· W2466100069 sur OpenAlexafffund
Alice Yang Zhang, Naveen Mysore, Hojatollah Vali, Jamie Koenekoop, Sang Ni Cao, Shen Li, Huanan Ren, Vafa Keser, Irma López-Solache, Sorath Noorani Siddiqui, Ayesha Khan, Jeannie Mui, Kelly P. Sears, Jim Dixon, Jeremy Schwartzentruber, Jacek Majewski, Nancy Braverman, Robert K. Koenekoop

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensMontreal Children's HospitalMcGill UniversityMcGill Genome Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChoroideremiaPathologyRetinal degenerationRetinalBiologyMedicineGeneticsOphthalmology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Photoreceptor neuronal degenerations are common, incurable causes of human blindness affecting 1 in 2000 patients worldwide. Only half of all patients are associated with known mutations in over 250 disease genes, prompting our research program to identify the remaining new genes. Most retinal degenerations are restricted to the retina, but photoreceptor degenerations can also be found in a wide variety of systemic diseases. We identified an X-linked family from Sri Lanka with a severe choroidal degeneration and postulated a new disease entity. Because of phenotypic overlaps with Bietti's crystalline dystrophy, which was recently found to have systemic features, we hypothesized that a systemic disease may be present in this new disease as well. METHODS: For phenotyping, we performed detailed eye exams with in vivo retinal imaging by optical coherence tomography. For genotyping, we performed whole exome sequencing, followed by Sanger sequencing confirmations and cosegregation. Systemic investigations included electron microscopy studies of peripheral blood cells in patients and in normal controls and detailed fatty acid profiles (both plasma and red blood cell [RBC] membranes). Fatty acid levels were compared to normal controls, and only values two standard deviations above or below normal controls were further evaluated. RESULTS: The family segregated a REP1 mutation, suggesting choroideremia (CHM). We then found crystals in peripheral blood lymphocytes and discovered significant plasma fatty acid abnormalities and RBC membrane abnormalities (i.e., elevated plasmalogens). To replicate our discoveries, we expanded the cohort to nine CHM patients, genotyped them for REP1 mutations, and found the same abnormalities (crystals and fatty acid abnormalities) in all patients. CONCLUSIONS: Previously, CHM was thought to be restricted to the retina. We show, to our knowledge for the first time, that CHM is a systemic condition with prominent crystals in lymphocytes and significant fatty acid abnormalities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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