Molecular Variability of <i>Celosia Argentea</i> Using Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) Marker
Notice bibliographique
Résumé
The molecular variability of ten genotypes of Celosia argentea seeds collected from National Institute of Horticultural Research (NIHORT) and National Centre for Genetic Resources and Biotechnology (NACGRAB) germplasms were evaluated using the Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) marker. The polymorphism of C. argentea was detected within the population using primer mix of AFLP EcoRI + MseI adaptors type in three primer combinations. Powermarker software V3.25 was statistically used to analyse the fragments from extracted DNA region. The highest concentrations of genomic DNA of 13.30 u/L and volume of 2217.59 u/L for total genomic DNA were recorded for NG/TO/MAY/09/015 and NG/MA/MAY/09/015 genotypes respectively. Variations were observed in the number of fragments amplified by each of the three AFLP primers combinations. The Polymorphic Information Content (PIC) of the amplified fragment of the genomic DNA was diverse at 89.1% for DNA size of 100 base pairs, while the percentage gene diversity was 90%. The primer sequence combination of AAC + CAG produced the highest number of bands, amplified fragments, and number of polymorphic bands of 400, 40, and 156.000 respectively. A dendrogram constructed revealed three cluster groups, in which clusters 1 and 3 were delineated into 4 genotypes each, while cluster 2 had the least with two genotypes. This study revealed variability among the genome of C. argentea using AFLP marker. This could promote improvement and conservation of C. argentea germplasm for broaden genetic basis of breeding program.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».