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Enregistrement W2467037522 · doi:10.1093/jac/dkw252

Positive regulation of the <i>Candida albicans</i> multidrug efflux pump Cdr1p function by phosphorylation of its N-terminal extension

2016· article· en· W2467037522 sur OpenAlexafffund
Sarah Tsao, Sandra Weber, Christine Cameron, Dominic Nehme, Elaheh Ahmadzadeh, Martine Raymond

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésATP-binding cassette transporterEffluxCandida albicansNile redBiologyMultiple drug resistanceMutantMicrobiologyBiochemistryDrug resistanceTransporterGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Overexpression of ATP-binding cassette (ABC) transporters is a frequent cause of multidrug resistance in cancer cells and pathogenic microorganisms. One example is the Cdr1p transporter from the human fungal pathogen Candida albicans that belongs to the pleiotropic drug resistance (PDR) subfamily of ABC transporters found in fungi and plants. Cdr1p is overexpressed in several azole-resistant clinical isolates, causing azole efflux and treatment failure. Cdr1p appears as a doublet band in western blot analyses, suggesting that the protein is post-translationally modified. We investigated whether Cdr1p is phosphorylated and the function of this modification. METHODS: Phosphorylated residues were identified by MS. Their function was investigated by site-directed mutagenesis and expression of the mutants in a C. albicans endogenous system that exploits a hyperactive allele of the Tac1p transcription factor to drive high levels of Cdr1p expression. Fluconazole resistance was measured by microtitre plate and spot assays and transport activity by Nile red accumulation. RESULTS: We identified a cluster of seven phosphorylated amino acids in the N-terminal extension (NTE) of Cdr1p. Mutating all seven sites to alanine dramatically diminished the ability of Cdr1p to confer fluconazole resistance and transport Nile red, without affecting Cdr1p localization. Conversely, a Cdr1p mutant in which the seven amino acids were replaced by glutamate was able to confer high levels of fluconazole resistance and to export Nile red. CONCLUSIONS: Our results demonstrate that the NTE of Cdr1p is phosphorylated and that NTE phosphorylation plays a major role in regulating Cdr1p and possibly other PDR transporter function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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