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Enregistrement W2467149097 · doi:10.1163/18759866-08501005

Mitochondrial evidence supports a Nearctic origin for the spreading limicolous earthworm Sparganophilus tamesis Benham, 1892 (Clitellata, Sparganophilidae)

2016· article· en· W2467149097 sur OpenAlexaboutno aff
Emilia Rota, Svante Martinsson, Marco Bartoli, Anneke Beylich, Ulfert Graefe, Alex Laini, Mark J. Wetzel, Christer Erséus

Notice bibliographique

RevueContributions to Zoology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInvertebrate Taxonomy and Ecology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesVetenskapsrådet
Mots-clésClitellataBiologyHaplotypeLineage (genetic)Evolutionary biologyZoologyNearctic ecozoneMitochondrial DNAPopulationGenealogyDivergence (linguistics)Taxonomy (biology)GeneticsDemographyGenotypeHistory

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We analysed samples of Sparganophilus taken at the corners of its distribution area in Europe (UK, Germany and Italy). No mitochondrial genetic divergence within and amongst them was found, neither in COI nor in 16S. Further, the COI haplotype was also identical to two sequences from Ontario, Canada in the Barcoding of Life Data System (BOLD) database. Our European COI and 16S sequences showed only minimal differentiation (only 1 or 2 substitutions) from specimens newly collected in Illinois and Washington states (USA), as well as from a COI haplotype from Tennessee (USA) in BOLD. An additional COI haplotype from Illinois (found in BOLD) is 2.1% different from the other haplotypes but clearly belongs to the same lineage of Sparganophilus . This geographically broad but genetically compact group fits the morphological diagnosis of S. tamesis Benham, 1892 as revised by Jamieson (1971) and is seen as evidence that all European populations 1) belong to the same species, 2) derive from a recent introduction, 3) are conspecific with the most widespread species of Sparganophilus in North America, and that 4) S. tamesis is a senior synonym of S. eiseni Smith, 1895. The single European haplotype does not refute the possibility of its spread from a single introduced source population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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