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Enregistrement W2467189203 · doi:10.1186/s12863-016-0409-y

QTL underlying some agronomic traits in barley detected by SNP markers

2016· article· en· W2467189203 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBMC Genetics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensSaint Mary's University
Organismes subventionnairesEarmarked Fund for China Agriculture Research SystemNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésQuantitative trait locusDoubled haploidyBiologyHordeum vulgareAgronomyCultivarGrain yieldPopulationHorticulturePoaceaeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Increasing the yield of barley (Hordeum vulgare L.) is a main breeding goal in developing barley cultivars. A high density genetic linkage map containing 1894 SNP and 68 SSR markers covering 1375.8 cM was constructed and used for mapping quantitative traits. A late-generation double haploid population (DH) derived from the Huaai 11 × Huadamai 6 cross was used to identify QTLs and QTL × environment interactions for ten traits affecting grain yield including length of main spike (MSL), spikelet number on main spike (SMS), spikelet number per plant (SLP), grain number per plant (GP), grain weight per plant (GWP), grain number per spike (GS), thousand grain weight (TGW), grain weight per spike (GWS), spike density (SPD) and spike number per plant (SP). RESULTS: In single environment analysis using composite interval mapping (CIM), a total of 221 QTLs underlying the ten traits were detected in five consecutive years (2009-2013). The QTLs detected in each year were 50, 48, 41, 41 and 41 for the year 2009 to 2013. The QTLs associated with these traits were generally clustered on chromosome 2H, 4H and 7H. In multi-environment analysis, a total of 111 significant QTLs including 18 for MSL, 16 for SMS, 15 for SPD, 5 for SP, 4 for SLP, 14 for TGW, 5 for GP, 11 for GS, 8 for GWP, and 15 for GWS were detected in the five years. Most QTLs showed significant QTL × environment interactions (QEI), nine QTLs (qIMSL3-1, qIMSL4-1, qIMSL4-2, qIMSL6-1, qISMS7-1, qISPD2-7, qISPD7-1, qITGW3-1 and qIGWS4-3) were detected with minimal QEI effects and stable in different years. Among 111 QTLs,71 (63.40 %) QTLs were detected in both single and multiple environments. CONCLUSIONS: Three main QTL cluster regions associated with the 10 agronomic traits on chromosome 2H, 4H and 7H were detected. The QTLs for SMS, SLP, GP and GWP were located in the region near Vrs1 on chromosome 2H. The QTLs underlying SMS, SPD and SLP were clustered on chromosome 4H. On the terminal of chromosome 7H, there was a QTL cluster associated with TGW, SPD, GWP and GWS. The information will be useful for marker-assisted selection (MAS) in barley breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,937
Score d'incertitude au seuil0,219

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle