MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2467783718 · doi:10.14288/1.0073003

Exploring the interaction environment of blood cells : proteomic analysis of platelet releasate and platelet-monocyte interaction

2012· article· en· W2467783718 sur OpenAlexaboutno aff
Arash Khosrovi-Eghbal

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePlatelet Disorders and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlateletMonocyteCell biologyComputational biologyChemistryBiologyGeneticsImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Platelet-monocyte aggregates circulating in the blood are found to play an important role in cardiovascular disease, the most common cause of death in Canada, and are now an established early marker of acute events. Upon stimulation, monocytes transmigrate across the endothelial layer into the intima where they take up oxidized low density lipoproteins (LDL) and differentiate into macrophages, and are then incorporated into atherosclerotic plaques. Upon plaque rupture, which accounts for the majority of fatal cardiovascular incidents, platelets are exposed to a variety of agonists such as collagen and mildly oxidized LDL. We used dimethyl labeling quantitative proteomics approach to determine the relative abundance of platelet releasate (Rel) proteins from platelets activated with thrombin, collagen or Lysophosphatidic acid (LPA; the most potent platelet activator found in mildly oxidized LDL). Using the different agonists led to releasates with unique protein compositions. In addition, we analyzed the relative abundance of protein in releasate free of microparticles (Rel-MP) when using the different agonists. Flow cytometry and proteomics studies showed that thrombin, collagen or LPA activated platelets not only produce different number of platelet microparticles (MP), but that these MP have different proteome profiles. We studied the effects of combining agonists by activating platelets with thrombin plus collagen or a subthreshold concentration of collagen plus LPA. Through biologic functional studies we saw that the Rel, Rel-MP or MP from the platelets activated with the different agonists lead to different degree of THP-1 cell migration. We added the contents released from thrombin activated platelets to a human monocytic cell line THP-1, in order to find the proteins which are responsible for THP-1 cell stimulation. Based on the increased expression of proteins such as integrin β1, we found that, adding platelet releasate induces a pro-inflammatory state in THP-1 cells and prime them for transmigration. Therefore, we have taken considerable strides towards uncovering the effect of platelet activation on monocyte protein expression. The findings may aid in discovery of drug targets for prevention of inappropriate platelet activation and platelet-monocyte aggregate formation, in order to dampen the effects of these events in contributing to cardiovascular disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuecIRcle (University of British Columbia)→Même sujetPlatelet Disorders and Treatments→Travaux en français237 207→