Transport of α-Helical Peptides through α-Hemolysin and Aerolysin Pores
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
A series of negatively charged alpha-helical peptides of the general formula fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc)-D(x)A(y)K(z) were synthesized, where x and z were 1, 2, or 3 and y was 10, 14, 18, or 22. The translocation of the peptides through single pores, which were self-assembled into lipid membranes, was analyzed by measuring the current blockade i(block) and the duration t(block). The pores were either alpha-hemolysin, which has a wide vestibule leading into the pore, or aerolysin, which has no vestibule but has a longer pore of a similar diameter. Many thousands of events were measured for each peptide with each pore, and they could be assigned to two types: bumping events (type I) have a small i(block) and long t(block), and translocation events (type II) have a larger i(block) and shorter t(block). For type-II events, both i(block) and t(block) increase with the length of the peptides on both pores tested. The dipole moment and the net charge of each peptide has a major effect on the transport characteristics. The ratio of type-II/type-I events increases as the dipole moment increases, and uncharged peptides gave mostly type-I events. The structural differences between the two nanopores were reflected in the characteristic values of i(block), and in particular, the vestibule of alpha-hemolysin helps to orient the peptides for translocation. Overall, the results demonstrate that the nanopore technology can provide useful structural information but peptide sequencing will require further improvements in the design of the pores.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle