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Enregistrement W2468455782 · doi:10.1242/jcs.191379

LAR protein tyrosine phosphatase regulates focal adhesions through CDK1

2016· article· en· W2468455782 sur OpenAlexaff
Adil R. Sarhan, Trushar R. Patel, Alana R. Cowell, Michael G. Tomlinson, Carina Hellberg, John K. Heath, Debbie L. Cunningham, Neil A. Hotchin

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesEuropean CommissionHigher Committee for Education Development in IraqBritish Heart Foundation
Mots-clésBiologyProtein tyrosine phosphataseFocal adhesionTyrosineCell biologyPhosphataseBiochemistryPhosphorylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Focal adhesions are complex multi-molecular structures that link the actin cytoskeleton to the extracellular matrix through integrin adhesion receptors and play a key role in regulation of many cellular functions. LAR (also known as PTPRF) is a receptor protein tyrosine phosphatase that regulates PDGF signalling and localises to focal adhesions. We have observed that loss of LAR phosphatase activity in mouse embryonic fibroblasts results in reduced numbers of focal adhesions and decreased adhesion to fibronectin. To understand how LAR regulates cell adhesion we used phosphoproteomic data, comparing global phosphorylation events in wild-type and LAR phosphatase-deficient cells, to analyse differential kinase activity. Kinase prediction analysis of LAR-regulated phosphosites identified a node of cytoskeleton- and adhesion-related proteins centred on cyclin-dependent kinase-1 (CDK1). We found that loss of LAR activity resulted in reduced activity of CDK1, and that CDK1 activity was required for LAR-mediated focal adhesion complex formation. We also established that LAR regulates CDK1 activity through c-Abl and Akt family proteins. In summary, we have identified a new role for a receptor protein tyrosine phosphatase in regulating CDK1 activity and hence cell adhesion to the extracellular matrix.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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